Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9yF8VPU6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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