Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3443F7CCV5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms