Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm28038F7BCN9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm28038F7BCN9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm28038F7BCN9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm28038F7BCN9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm28038F7BCN9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm28038F7BCN9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm28038F7BCN9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm28038F7BCN9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28038F7BCN9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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