Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm10378F6XQQ1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms