Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8247F6VRJ8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms