Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf212F6TQD1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf212F6TQD1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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