Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph10bE9PYQ0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms