Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm6685D3YYP3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm6685D3YYP3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms