Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Rnf217D3YYI7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Rnf217D3YYI7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf217D3YYI7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf217D3YYI7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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