Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SafbD3YXK2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SafbD3YXK2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms