Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Phf11bB4XVQ1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Phf11bB4XVQ1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Phf11bB4XVQ1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Phf11bB4XVQ1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf11bB4XVQ1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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