Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms