Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp8b5A3FIN4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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