Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
H2al1jA2BFR3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms