Protein–RNA interactions for Protein: S4R185

Gm26938, Predicted gene, 26938 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26938S4R185 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm26938S4R185 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm26938S4R185 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm26938S4R185 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm26938S4R185 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm26938S4R185 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm26938S4R185 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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