Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Top3bQ9Z321 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Top3bQ9Z321 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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