Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Knop1Q9Z2Q2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms