Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Crlf3Q9Z2L7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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