Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lgr5Q9Z1P4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lgr5Q9Z1P4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lgr5Q9Z1P4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lgr5Q9Z1P4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lgr5Q9Z1P4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lgr5Q9Z1P4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lgr5Q9Z1P4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lgr5Q9Z1P4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lgr5Q9Z1P4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lgr5Q9Z1P4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lgr5Q9Z1P4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lgr5Q9Z1P4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lgr5Q9Z1P4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms