Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn13Q9Z0S4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn13Q9Z0S4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn13Q9Z0S4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn13Q9Z0S4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn13Q9Z0S4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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