Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AmfrQ9R049 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms