Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Col4a4Q9QZR9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Col4a4Q9QZR9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Col4a4Q9QZR9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Col4a4Q9QZR9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col4a4Q9QZR9 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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