Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ripk3Q9QZL0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms