Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ChmlQ9QZD5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms