Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phtf1Q9QZ09 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phtf1Q9QZ09 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms