Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nr2e3Q9QXZ7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms