Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dclk1Q9JLM8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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