Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pkd2l2Q9JLG4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms