Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpa33Q9JKA5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpa33Q9JKA5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpa33Q9JKA5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpa33Q9JKA5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpa33Q9JKA5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gpa33Q9JKA5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gpa33Q9JKA5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gpa33Q9JKA5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms