Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms