Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ndufs3Q9DCT2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ndufs3Q9DCT2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms