Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tspan4Q9DCK3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tspan4Q9DCK3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tspan4Q9DCK3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tspan4Q9DCK3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tspan4Q9DCK3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tspan4Q9DCK3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tspan4Q9DCK3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tspan4Q9DCK3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tspan4Q9DCK3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Tspan4Q9DCK3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan4Q9DCK3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms