Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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Csnk1dQ9DC28 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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