Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc89Q9DA73 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc89Q9DA73 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms