Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx5Q9D8U8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms