Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fip1l1Q9D824 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fip1l1Q9D824 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fip1l1Q9D824 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fip1l1Q9D824 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fip1l1Q9D824 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fip1l1Q9D824 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fip1l1Q9D824 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fip1l1Q9D824 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms