Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pfn4Q9D6I3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms