Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm5Q9D6G9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmtm5Q9D6G9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 548.5 ms