Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp35Q9D384 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms