Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tspan11Q9D1D1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tspan11Q9D1D1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms