Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Mrpl28Q9D1B9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Mrpl28Q9D1B9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Mrpl28Q9D1B9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl28Q9D1B9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Mrpl28Q9D1B9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Mrpl28Q9D1B9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Mrpl28Q9D1B9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Mrpl28Q9D1B9 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Mrpl28Q9D1B9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Mrpl28Q9D1B9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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