Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkapQ9D0F4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NkapQ9D0F4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NkapQ9D0F4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NkapQ9D0F4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NkapQ9D0F4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NkapQ9D0F4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NkapQ9D0F4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NkapQ9D0F4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkapQ9D0F4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkapQ9D0F4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkapQ9D0F4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkapQ9D0F4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkapQ9D0F4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms