Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rpl11Q9CXW4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl11Q9CXW4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms