Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Kdm8Q9CXT6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Kdm8Q9CXT6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm8Q9CXT6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms