Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed5Q9CXE7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms