Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms