Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Pfdn1Q9CWM4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pfdn1Q9CWM4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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