Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rprd1bQ9CSU0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms