Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Mrpl35Q9CQL6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms