Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms